有影響。從關(guān)聯(lián)分析的方法上，有親本的BSA我們會有兩種關(guān)聯(lián)分析方法，SNP-Index和ED，最后的定位結(jié)果是兩種方法的交集，無親本的只能用ED的方法進行關(guān)聯(lián)分析。有親本的作用是排除親本非多態(tài)性標記對定位的影響，舉例說明一下，有一個標記在混池間是有多態(tài)性的，但在親本上是沒有多態(tài)性，如果有親本，我們的定位結(jié)果是不會有這樣的標記，但是沒有親本，定位結(jié)果中就會有這樣的標記，定位的區(qū)域會變大，假陽性較多。