捕獲效率是指測得比對到目標區(qū)域的序列（有效序列）占全部比對到參考基因組的序列的比例；捕獲效率的高低不影響數(shù)據(jù)質(zhì)量，只影響數(shù)據(jù)的有效比例。一般目標區(qū)域的捕獲效率在60-70%，羅氏和安捷倫等外顯子捕獲試劑盒的目標區(qū)域大小在60Mb左右，即測序深度=10G*60%/60Mb=100X。